Hej
Börja med att kontakta skatteverket och fråga dem om du får lov att lägga in detta i en senare månad för att slippa låsa upp och göra om momsredovisningarna. Då fakturan inkommit sent som jag förstår det så borde det inte vara några problem.
Lägg sedan in fakturan manuellt istället via Bokföring > Verifikationer > Ny verifikation.
/Joachim